益生菌可能有助于辅助治疗部分肠炎，但不能完全替代药物治疗。肠炎的治疗需根据具体病因选择针对性方案。
对于病毒性或轻度细菌性肠炎，益生菌可能通过调节肠道菌群平衡、抑制有害菌生长、增强肠道屏障功能等机制缓解腹泻和腹痛症状。临床常用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌制剂，这类情况通常伴随自限性特征，在医生指导下配合补液和饮食调整后，症状可能逐渐改善。
若肠炎由严重细菌感染、寄生虫或炎症性肠病引起，单纯使用益生菌难以控制病情。细菌性痢疾需用左氧氟沙星片等抗生素，溃疡性结肠炎可能需要美沙拉嗪肠溶片配合激素治疗。此时益生菌仅作为辅助手段，过量使用反而可能干扰病原体检测或加重腹胀等不适。
肠炎患者应注意补充水分和电解质，选择低渣、低脂的流质或半流质饮食，避免辛辣刺激食物。若出现持续发热、血便或脱水症状，须立即就医。使用益生菌前应咨询医生，避免与抗生素同时服用而影响疗效，储存时需注意避光防潮以保持活性。
